Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01822 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01822 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01822 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01822 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01822 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01822 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01822 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01822 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01822 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01822 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01822 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01822 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01822 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01822 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01822 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01822 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01822 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01822 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01822 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01822 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01822 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms