Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01679 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01679 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01679 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01679 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01679 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01679 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01679 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01679 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01679 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01679 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01679 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01679 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01679 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01679 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01679 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01679 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01679 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01679 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01679 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01679 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01679 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01679 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms