Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01663 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01663 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01663 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01663 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms