Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01660 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01660 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01660 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01660 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01660 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01660 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01660 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms