Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01656 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01656 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01656 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01656 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01656 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01656 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01656 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01656 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01656 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01656 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01656 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01656 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01656 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01656 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01656 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01656 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01656 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01656 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms