Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01654 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01654 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01654 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01654 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01654 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01654 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01654 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01654 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01654 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01654 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01654 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01654 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01654 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01654 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01654 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01654 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01654 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01654 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms