Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01649 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01649 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01649 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01649 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01649 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01649 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01649 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01649 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01649 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01649 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01649 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01649 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01649 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01649 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms