Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lancl1O89112 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms