Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms