Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F11rO88792 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F11rO88792 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F11rO88792 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F11rO88792 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F11rO88792 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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