Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn3O88705 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn3O88705 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms