Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hcn2O88703 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hcn2O88703 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms