Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3aO88508 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms