Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ntsr1O88319 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms