Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtssO70370 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtssO70370 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtssO70370 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtssO70370 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtssO70370 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtssO70370 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtssO70370 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtssO70370 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms