Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx4O55187 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms