Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx3O55144 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx3O55144 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms