Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms