Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl13O55038 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl13O55038 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms