Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copb2O55029 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Copb2O55029 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Copb2O55029 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Copb2O55029 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Copb2O55029 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Copb2O55029 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copb2O55029 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copb2O55029 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copb2O55029 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copb2O55029 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copb2O55029 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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