Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms