Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5r2O35926 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms