Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms