Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp2O35711 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms