Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms