Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkd2O35245 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms