Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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