Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms