Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ncoa3O09000 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms