Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Dctn1O08788 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms