Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nfil3O08750 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfil3O08750 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nfil3O08750 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfil3O08750 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfil3O08750 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfil3O08750 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfil3O08750 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfil3O08750 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfil3O08750 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms