Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms