Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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