Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa3bJ9JI28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms