Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms