Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10428J3QNV7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm10428J3QNV7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10428J3QNV7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms