Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms