Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21411J3KMS0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21411J3KMS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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