Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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