Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubgcp6G5E8P0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubgcp6G5E8P0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Tubgcp6G5E8P0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Tubgcp6G5E8P0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubgcp6G5E8P0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms