Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17ldG5E8G2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17ldG5E8G2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17ldG5E8G2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms