Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3tc1G3X9F6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms