Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms