Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6F8VPZ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms