Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms