Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms