Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms