Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms