Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raph1F2Z3U3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raph1F2Z3U3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms