Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cald1E9QA15 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms